Del latín trans-septum (al otro lado de la barrera), esta nave se suele interponer entre la cabecera en la que se integran la capilla mayor y el coro, destinada a clérigos y oficiantes, y los tramos posteriores de la nave o naves longitudinales donde se alojaban los fieles.
No es raro encontrar que al transepto se le denomine impropiamente crucero.
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